Los orígenes de la Facultad se remontan a 1947, cuando fue llamada Facultad de Ciencias Físicas y Matemáticas, se creó el Departamento de Ciencias Naturales con el Propósito de formar profesionales en biología, física, matemática y química.
Pronto el Departamento se transformó en Escuela de Ciencias, que es incorporada posteriormente a la Facultad de Farmacia, hasta que el 3 de marzo de 1958 se convierte en la Facultad de Ciencias con tres Escuelas: Biología, Física y Matemática, y Química. La fundación de la Facultad se produjo bajo la gestión del Rector Francisco De Venanzi y su primer Decano fue el Profesor Francisco Texera. Al momento de su fundación la Facultad apenas contaba con unos 100 estudiantes y menos de 50 profesores. A estas cuatro disciplinas iniciales se agregaron luego las de Computación (1968) y Geoquímica (1996).
La investigación científica básica y aplicada fue la base fundamental sobre la cual descansaron sus estudios desde su fundación. No se concibe la docencia en ciencias sin una actividad de investigación que le dé sustento. Pronto las necesidades del país y los requerimientos de la ciencia moderna, demandaron la creación de unidades de investigación cada vez más complejas e interactivas, algunas de las cuales se encuentran ubicadas dentro de las Escuelas y otras se han nucleado en Institutos y centros de investigación.
La historia de la Facultad puede ser contada con la voz de sus casi 7.000 egresados, quienes han sembrado a lo largo de nuestra geografía el culto a la búsqueda de la verdad. Nuevas Facultades de Ciencias en casi todas las universidades del país han sido fundadas por nuestros calificados egresados, Facultades que reproducen la misión de investigar, educar y divulgar la ciencia en Venezuela.
Actualmente conforman la Facultad de Ciencias de la Universidad Central de Venezuela las escuelas de Biología, Computación, Física, Matemática, Química, Computación y Matemática; Institutos de Investigación, Ciencias de la Tierra, Zoología y Ecología Tropical, Ciencia y Tecnología de Alimentos y el de Biología Experimental
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